SønderjyskE Fodbold er fodboldafdelingen i Sønderjysk Elitesport. Klubben spiller i den næstbedste danske række NordicBet Ligaen og hjemmebanen hedder Sydbank Park som har plads til 10.100 tilskuere som fordeler sig på henholdsvis 5.100 siddepladser og 5.000 ståpladser.

SønderjyskE har i mange år været en fast bestanddel af Superligaen med et par enkelte ture ned i NordicBet Ligaen. Klubben rykkede op i Superligaen, under den nystiftede organisation, første gang i sæsonen 2005/2006, men måtte i den efterfølgende sæson tage til takke med en 11. plads og nedrykning til 1. division.

Klubben vendte dog efter bare to sæsoner i 1. division tilbage til Superligaen i sæsonen 2008/2009 og forblev denne gang en fast del af Superligaen de kommende 14 sæsoner med det hidtidige højdepunkt i sæsonen 2015/2016, hvor klubben kæmpede sig til et sæt sølvmedaljer og deltagelse i Europa League-kvalifikationen.

Her blev SønderjyskE, efter at have besejret norske Strømsgodset IF og polske Zaglebie i de første to runder af kvalifikationen, elimineret i kvalifikationsturneringen af tjekkiske Sparta Prag.

I sæsonen 2019/2020 vandt SønderjyskE sin første pokaltitel ved at vinde finalen af den 66. udgave af DBU Pokalen over AaB.

Det kastede endnu et europæisk fodboldeventyr af sig hvor klubben denne gang stod overfor tjekkiske Viktoria Plzen. I 2020/2021-sæsonen blev der spillet uden returopgør grundet COVID-19-situationen i Europa og denne gang blev SønderjyskE elimineret via et 3-0-nederlag i Europa League-kvalifikationens tredje runde.

Til sæsonen 2022/2023 af NordicBet Ligaen har der været følgende udskiftninger i SønderjyskE’s trup:

Ind:

  • Adnan Hadzic
  • Victor Ekani
  • Mads Hansen
  • Sefer Emini
  • Troels Kløve
  • Christoffer Remmer
  • Rasmus Wikstrøm
  • Mikkel Hyllegaard
  • Marcus Alstrup
  • Marcus Kristensen
  • Ryan Johnson Laursen
  • Magnus Nissen

Ud:

  • Rilwan Hassan
  • Thomas Lawrence
  • Tobias Ryborg
  • Robin Schouten
  • Nicolaj Thomsen
  • Stefan Gartenmann 
  • Daniel Prosser
  • Bubacarr Sanneh
  • Emil Kornvig
  • Faris Moumbagna
  • Emil Holm
  • Benjamin Schubert
  • Isak Jensen
  • Lasse Heisen
  • Philip Østerbæk